Mint az már több bejegyzésből is kiderült, az állomásnak mindössze két vonatfogadó vágánya van, akárcsak a Gyermekvasút összes többi állomásának. Az átmenő fővágány a második vágány, azaz a nyílt vonali vágány ezen keresztül folytatódik egyenes állású váltókon át. Szépjuhászné ebben egyedülálló a Gyermekvasút középállomásai között.A két vágány között, valamint az első vágánynak a felvételi épület felőli oldalán a sínkorona magasságáig feltöltött peron van. A két vágány tengelyének távolsága az előírt legkisebb, valamivel több mint négy méter. Alul- és felüljáró hiányában és a keskeny peron miatt a vonatközlekedés lebonyolításakor igen szigorú utas- és munkavédelmi szabályokat kell betartani.
A II. vágány hossza 110 méter, az I. vágány 112 méter hosszú. A Gyermekvasúton általában közlekedő két- vagy háromkocsis dízelmozdonyos vonatok részére ez elegendő, hiszen ezek hossza 42, illetve 58 méter. De még azok a hosszú, ritkán közlekedő vonatok is beférnek a vágányokra, amelyek öt személykocsiból és két mozdonyból állnak, és amelyek hossza 100 méter.
A vasútvonal első és második építési szakaszának tervezésekor a vágányok hosszát úgy állapították meg, hogy az eredetileg tervezett motorvonat szerelvényekből kettő elférjen minden vonatfogadó vágányon. A ma is közlekedő nosztalgia motorkocsi és egy mellékkocsijából álló szerelvény hossza 25 méter, azaz elmondható, hogy az állomást igencsak nagyvonalúan, tágasnak építették meg. A harmadik építési szakasznál már hosszabb szerelvényekkel számoltak, ezért lettek Hárs-hegy és Hűvösvölgy állomás vágányai sokkal hosszabbak.
